Le Comitat de Vukovar-Syrmie est situé à l'extrémité nord-est de la République de Croatie. S'étendant entre le Danube et la Save, il occupe les parties des régions historiques de Slavonie orientale et de Syrmie occidentale. Les différences d'altitude sont faibles dans ce secteur. Le sommet Čukala près d'Ilok est son point le plus haut (294 m d'altitude), tandis que son point le plus bas se trouve dans la Posavina - Spačva (78 m d'altitude). A l'est, les collines du mont Fruška gora descendent en pente douce et rejoignent le plateau de Vukovar. Le plateau de Vinkovci et de Đakovo s'étend depuis le mont Dilj-gora, à l'ouest.
Les voies navigables et terrestres importantes traversent cette région, où se croisent les axes de transport internationaux reliant l'est et l'ouest à travers le Danube, le nord et le sud à travers la Save vers la mer Adriatique. C'est l'endroit où entrent en contact et se confrontent les civilisations et cultures de l'Occident européen et de l'Orient. Au nord de Vinkovci, la rivière Vuka se jette dans le Danube près de la ville de Vukovar, tandis que plus au sud, le Bosut avec ses affluents (la Berava, le Biđ, la Studva et la Spačva) coule vers la Save. Riches en poissons, ces rivières ont influencé la continuité de la vie dans cet espace, de même que les terres fertiles lœssiques. De nombreuses forêts de chêne ayant poussé dans la partie méridionale du Comitat, autrefois couverte de marécages, ont également contribué à la densité de population.
