Franjevci su u Iloku sigurno od 1343. godine. Franjevačku i župnu crkvu sv. Ivana Kapistrana u Iloku dao je graditi u gotičkom stilu vojvoda Ugrin i završena je 1349. godine. U vrijeme izgradnje crkva je posvećena Majci Božjoj na nebo uzetoj. Od 1700. godine crkva je posvećena talijanskom Franjevcu Ivanu Kapistranu, pokopanom u franjevačkoj crkvi, a proglašenog svecem 1690. godine. Kao nadgrobna crkva sveca postala je premala. Zato ju 1468. Godine daje produžiti Nikola Iločki kada dobiva današnju dužinu.Poslije 1688. godine dolazi katolički narod iz Bosne i Franjevci iz Olova koji obnavljaju crkvu i samostan. Tada je crkva dobila neke karakteristike baroka. Godine 1906. - 1912. zadnja je velika obnova crkve po nacrtima arhitekta Hermana Bolle-a, kada je obnovljena u novogotičkom stilu. Godine 1913. izgrađen je sadašnji toranj, koji je četvrti po redu. Oltarna slika prikazuje sv. Ivana Kapistrana pod beogradskom tvrđavom, a radio ju je bečki slikar Josip Kesller (1862.). Uz crkvu nalazi se kapela-soba u kojoj je, prema tradiciji, umro sv. Ivan Kapistran. Sliku "Blagoslov sv. Ivana Kapistrana" radio je 1908. godine Mirko Rački. Franjevački samostan je dijelom iz srednjega vijeka (zapadno krilo), a do 1727.godine izgrađeno je sjeverno i istočno krilo, tj. dobio je današnji izgled.
